全国肛肠疾病防治工程定点医院的遴选是由中国中西医结合学会大肠肛门病专业委员会组织并在全国范围内开展的，目的是为了大力推广肛肠疾病诊疗最前沿技术和先进临床经验，帮助我国各个地区的肛肠科医学的发展注入新的学术理念，推动我国常见病的防治，提高基层医疗卫生水平和服务能力。广东省中西医结合医院是佛山地区唯一一家定点医院。通过“全国肛肠疾病防治工程定点医院”的平台，将全面帮助和指引专科更科学、更有效、更直接的提高职业素质和技术水平。同时，通过权威、高端的国际医学交流带来全新的诊疗理念、先进的诊疗技术以及前沿的医学合作。

医院肛肠科已发展成为集临床、教学、科研于一体的临床二级科室，科室规模不断壮大，临床业务能力大幅度提高，医疗服务水平进一步提升，是南海区“十二五”医学重点专科。肛肠科中医中药特色治疗贯穿于肛肠疾病治疗的始末。能开展肛肠科常见病、多发病及疑难杂症的诊断及治疗。特别在痔PPH、RPH、TST微创术及肛周脓肿、肛瘘的小切拖线疗法等微创手术方面在本地区属领先地位。